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講義ノート

プロフィール
京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 教授
阿久津達也

略歴
1989年3月 東京大学大学院工学系研究科情報工学専攻博士課程修了(工学博士)
1989年4月~1994年3月 通商産業省工業技術院機械技術研究所研究員
1994年4月~1996年3月 群馬大学工学部情報工学科助教授
1996年4月~2001年9月 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター助教授
2001年2月~2001年8月 カリフォルニア大学バークレー校客員研究員
2001年11月~2003年3月 京都大学大学院情報学研究科知能情報学専攻併任教授
2001年10月~ 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター教授
2020年4月~ 国立情報学研究所客員教授
研究分野
バイオインフォマティクス
複雑ネットワーク
離散アルゴリズム
ニューラルネットワーク
メールアドレス
takutsu AT kuicr DOT kyoto-u DOT ac DOT jp

著書
阿久津達也・ホセ ナチェル, 「複雑ネットワークと制御理論」 ,共立出版,2023年6月刊行.
阿久津達也, 「バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム」 ,共立出版,2007年2月刊行(Errata).
丸山修・阿久津達也, 「バイオインフォマティクス -配列データ解析と構造予測-」 ,朝倉書店,2007年5月刊行.
訳書
阿久津達也・竹本和広, 「バイオインフォマティクス -Pythonによる実践レシピ-」, 朝倉書店, 2020.
(原書 T. Antao:Bioinformatics with Python Cookbook. Second Edition)
阿久津達也・浅井潔・矢田哲史, 「バイオインフォマティクス - 確率モデルによる遺伝子配列解析」, 医学出版, 2001.
(原書 R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison:Biological Sequence Analysis)

論文リスト
解説記事等

研究室のページ

委員等
プログラム委員長
  GIW96 GIW2004, IIBM2013
プログラム委員(バイオインフォマティクス関連)
  CSB2005-2010, OSB/ISB2007-2014, AB2007-2008, RECOMB2005-2014, PRIB2006-2014
  APBC2005-2015, GIW2010-2011, 2013-2014, BIRD2007, CIBCB2007, CASB2006
  ACCSA2006, AINA2006, BIOKDD2006, WABI2005,2011-2014, ECCB2005,2008
  ISMB2001-2011,2013-2014, DTMBIO2008-2009,2012-2014, BIDM2004-2005, BIBE2004-2005, BIOKDD04,
  GIW2000-2003, GIW2005-2006, BIBM2010-2014, ACM-BCB2010-2011,
  IIBM2008-2012, InCoB2010-2014, CSBio2013-2014, BIOINFORMATICS2011-2015
プログラム委員(アルゴリズム理論・データマイニング関連)
  CPM2002,2005,2007,2009, SPIRE2009, IEA/AIE2007 FCT2005, COCOON2005,2011
  ISAAC2003, ISAAC96, DAWAK2001-2004, PAKDD99-2000
組織委員
  CPX-NETWORK2012(Co-Organizer)
  CBI-JSBi2011(Co-Chair), IBSB2010(Chair), APBC2008(Chair)
  GENSIPS2007, AB2005, BIOINFO2005, RECOMB2000
英文誌編集委員
  IPSJ Transactions on Bioinformatics (Editor in Chief, 2006-2009)
  Advances in Bioinformatics (Editorial Board, 2008-2015)
  BMC Bioinformatics (Associate Editor, 2010-2022)
  Current Bioinformatics (Editorial Advisory Board, 2007-2010)
  EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (Associate Editors, 2014-2016)
  IEEE/ACM-TCBB (Associate Editor, 2011-)
  International Journal of Data Mining and Bioinformatics (Editorial Board, 2010-)
  International Journal of Knowledge Discovery in Bioinformatics (Editorial Board, 2010-2018)
  BioMed Research International (Editorial Board, 2009-2015)
  Journal of Computational Biology (Editorial Board, 2014-)
  Mathematical Biosciences (Editorial Board, 2010-2018)
  Mathematical Modelling and Applied Computing (Editorial Board, 2010-)
 
情報処理学会バイオ情報学研究会主査(平成19年度~20年度)
電子情報通信学会コンピューテーション研究会副委員長(平成16~17年度)
人工知能学会理事(平成15~16年度)
情報処理学会研究会論文誌「数理モデル化と応用」編集委員長(平成14~15年度)
バイオインフォマティクス学会評議員(平成14~15年度、平成23~24年度)
情報処理学会誌編集委員会基礎理論ワーキンググループ主査(平成12年度)
人工知能学会誌編集委員(平成10~12年度)
情報処理学会アルゴリズム研究会幹事(平成8~9年度)

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