プロフィール

氏名：市原　寿子（いちはら　ひさこ）

所属：京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター人材養成ユニット（振興調整費）

職名：特任助手

学位：博士（システム生命科学）(2007/01 九州大学)

専門分野：計算分子生物学、分子進化学、タンパク質工学

E-mail：ichihara(at)kuicr.Kyoto-u.ac.jp

TEL / FAX : 0774-38-3093 / 3059

研究・教育歴：

  • 2000.3; 奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科分子生物学専攻博士前期課程　修了
  • 2000.4〜2001.12; (株)生物分子工学研究所情報解析研究部門研究員
  • 2002.1〜2002.9; 技術研究組合 生物分子工学研究所生命情報研究部研究員
  • 2002.10〜; 京都大学化学研究所 特任助手

主な研究テーマ

  • 相同アミノ酸配列の比較によるタンパク質の機能・構造情報の抽出
  • タンパク質の機能および立体構造の分子進化
  • 相互作用解析による生物学的機能情報の抽出

文献リスト<原著論文>

  • Okada K, Ichihara H, Takahashi H, Fujita N, Ishihama A and Hakoshima T. "Preparation and preliminary X-ray diffraction analysis of crystals of bacterial flagellar sigma factor σ28 in complex with the σ28-binding region of its antisigma factor, FlgM." Acta Crystallogr. F, accepted.
  • Ichihara H, Kuma K and Toh H. "Positive selection in the ComC-ComD system of Streptococcal Species." J. Bacteriol. 188, 6429-6434 (2006).
  • Ichihara H, Daiyasu H and Toh H. "How does a topological inversion change the evolutionary constraints on membrane proteins?" Protein Eng. Des. Sel. 17, 235-244 (2004)
  • Ichihara H, Jingami H and Toh H. "Three novel repetitive units of reelin." Mol. Brain Res. 97, 190-193 (2001)

文献リスト<総説・著書>

  • バイオインフォマティクス事典（日本バイオインフォマティクス学会編集・共立出版）（2006.06）次の四項目を分担執筆 - 原核生物の遺伝子構造（生物科学・分子生物学基礎）・真核生物の遺伝子構造（生物科学・分子生物学基礎）・遺伝子重複（ゲノム遺伝解析・進化学）・シンテニー（ゲノム遺伝解析・ゲノムの進化）-
  • 市原　寿子、藤　博幸 「バイオインフォマティクス入門-要素と相互作用、個別と網羅の観点から-」 Bio・IT World. 2, 49-63 (2003)
  • 藤　博幸、市原　寿子「ゲノム情報を利用したタンパク質ネットワークの再構築」実験医学別冊・注目のプロテオミクスの全貌を知る-最新手法とその応用成果-, 128-134 (2003)
  • 市原　寿子、藤　博幸 「Evolutionary Traceを利用してタンパク質の相互作用情報を読みとる」蛋白質核酸酵素, 47, 1863-1869 (2002)