2005 年度　輪読会・論文紹介


2005.9.21 (水) 10:30 CB313
Inferring Phylogenies 18章
担当：加藤 和貴


2005.10.27 (木) 14:30 CB315
論文紹介
Identification of competence pheromone responsive genes
in Streptococcus pneumoniae by use of DNA microarrays
Peterson SN, et al.
Molecular Microbiology(2004) 51, 1051-1070　他 数報
担当：市原 寿子


2005.11.17 (木) 18:00 CB315
論文紹介
Mintseris J, Weng Z.
Structure, function, and evolution of transient and obligate protein-protein interactions.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 Aug 2;102(31):10930-5.

Socolich M, Lockless SW, Russ WP, Lee H, Gardner KH, Ranganathan R.
Evolutionary information for specifying a protein fold.
Nature. 2005 Sep 22;437(7058):512-8.
担当：佐藤 哲也


2005.12.1 (木) 15:00 CB310
論文紹介
Sillerud LO, Larson RS
Design and structure of peptide and peptidomimetic antagonists of
protein-protein interaction.
Curr Protein Pept Sci. 2005 Apr;6(2):151-69.
担当：根本 航


2005.12.27 (火) 15:00 CB313
Inferring Phylogenies 19章
担当：藤 博幸


2006.1.18 (水) 17:00 CB313
Inferring Phylogenies 19章の続き
担当：藤 博幸


2006.1.26 (木) 13:30 CB315
無顎類の獲得免疫系に関連した論文３報
Pancer Z et al. (2004) Nature 430, 174-180.
Pancer Z et al. (2005) PNAS 102, 9224-9229.
Alder MN et al. (2005) Science 310, 1970-1973.
担当：小島 健司


2006.2.16(木) 17:00 CB315
Inferring Phylogenies 19章 第３回
担当：藤 博幸


2006.2.23(木) 16:00 CB315
Mammalian non-coding RNAs についての論文
Science (2005) 309, 1559-1563.
Genome Research (2006) 16, 11-19.
担当：隈 啓一


2006.4.20(木) 16:00 CB315
No Transcription-Translation Feedback in Circadian Rhythm of KaiC
Phosphorylation.
Tomita, J. , Nakajima, M., Kondo, T., Iwasaki, H.
Science 2005 (307) p251-254

Reconstitution of Circadian Oscillation of Cyanobacterial KaiC
Phosphorylation in Vitro.
Nakajima, M. et al.
Science 2005 (308) p414-415
担当：岡本　忍


2006.4.27(木) 13:30 CB315
Inferring Phylogenies 20章
担当：市原 寿子


2006.5.25(木) 13:30 CB204
論文紹介
- Intrinsically unstructured proteins and their functions Dyson, H.J. &
Wright, P.E. (2005) Nature Reviews: Molecular Cell Biology 6, 197-208.
- Flexible Nets: The roles of intrinsic disorder in protein interaction
networks Dunker, A.K., Cortese, M.S., Romero,P., Iakoucheva, L.M.,
Uversky, V.M. (2005) FEBS J. 272, 5129-5148.
担当：藤 博幸


2006.6.28(水) 13:30 CB313
Inferring Phylogenies 20章(2)
担当：市原 寿子


2006.9.28(木) 16:00 CB204
論文紹介
Reading protein modifications with interaction domains.
Seet BT, Dikic I, Zhou MM, Pawson T.
Nat Rev Mol Cell Biol. 2006 Jul;7(7):473-483. Review.
担当：佐藤 哲也


2006.10.20(金) 13:00 CB313
論文紹介
DSCAMに関連した論文２報 他
Chen BE et al. (2006) Cell 125, 607-620.
Dong Y et al. (2006) PloS Biology 4, 1137-1146.
担当：市原　寿子

2006.11.30 (木) 13:30 CB204
「昆虫の細胞内共生とゲノムサイズの縮小」に関する論文4報
(1) Shigenobu S, Watanabe H, Hattori M, Sakaki Y, Ishikawa H.
Genome sequence of the endocellular bacterial symbiont of aphids Buchnera sp. APS.
Nature. 2000 Sep 7;407(6800):81-6.
(2) Perez-Brocal V, Gil R, Ramos S, Lamelas A, Postigo M, Michelena JM,
Silva FJ, Moya A, Latorre A.
A small microbial genome: the end of a long symbiotic relationship?
Science. 2006 Oct 13;314(5797):312-3.
(3) Wu D, Daugherty SC, Aken SE, Pai GH, Watkins KL, Khouri H, Tallon LJ,
Zaborsky JM, Dunbar HE, Tran PL, Moran NA, Eisen JA.
Metabolic Complementarity and Genomics of the Dual Bacterial Symbiosis of Sharpshooters.
PLoS Biol. 2006 Jun 6;4(6):e188
(4) Nakabachi A, Yamashita A, Toh H, Ishikawa H, Dunbar HE, Moran NA, Hattori M.
The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella.
Science. 2006 Oct 13;314(5797):267.
担当：小島 健司


2006.12.25(月) 14:45 CB313
Inferring Phylogenies 20章(2)
担当：市原 寿子


2007.1.25(木) 14:00 CB204
Inferring Phylogenies 21章
担当：隈 啓一


2007.2.21(水) 13:30 CB313
論文紹介
Metagenome analysis.
(1) Tyson GW et al. (2004) Nature 428, 37-43.
(2) Ram RJ et al. (2005) Science 308, 1915-1920.
(3) Venter JC (2004) Science 304, 66-74.
(4) Tringe SG et al. (2005) Science 308, 554-557.
(5) Eckburg PB et al. (2005) Nature 308, 1635-1638.
担当：隈 啓一