京都大学 化学研究所
バイオインフォマティクスセンター
特任教授

1. Evolutionary trace法の定量化手法の開発
アクアポリンと ClC塩素イオンチャンネルは、２つの相同なドメインから構成される膜タンパク質であるが、２つのドメインの膜に対する配向は逆転している。今回、２つのドメインのアラインメントから、細胞内外の環境から異なる選択圧を受けているサイトを検出する方法を開発した。

2. Class A GPCR 複合体のインターフェイス予測法の開発 GPCRは複合体を形成することが知られている。今回、立体構造が決定されているロドプシンをメンバーとして含むClass A GPCRについて、分子系統樹、アミノ酸保存度、立体構造の情報を統合的に利用して、そのインターフェイスを予測する方法を開発した。

3. 肺サーファクタントタンパク質 Cの分子進化的解析 肺サーファクタント蛋白質Ｃはサーファクタントの表面活性作用を担っており、新生児呼吸窮迫症候群の治療薬としても用いられている。今回、分子系統解析により肺サーファクタント蛋白質Ｃの進化的起源を調べた。

4. Cryptochrome DASHの新規メンバーの検出 Cryptochromeの中でも小さなサブファミリーであったDASHを、ほぼ全ての植物が有している事、脊椎動物にも存在することなどを分子系統解析によって明らかにした。

その他
本年度出版されたテキスト「タンパク質機能解析のためのバイオインフォマティクス」が大川出版賞を受賞した。